Human Parvovirus: Bocavirus

Abstract

Provided herein are sequences of the genomes and encoded proteins of a new human parvovirus, Bocavirus-2, and variants thereof. Also provided are methods of detecting the Bocavirus-2 and diagnosing Bocavirus-2 infection, methods of treating or preventing Bocavirus-2 infection, and methods for identifying anti-Bocavirus-2 compounds.

1 . An isolated nucleic acid molecule comprising a nucleotide sequence having at least 80% identity to SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:13, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:43, SEQ ID NO:49, or a complement thereof. 
     
     
         2 - 8 . (canceled) 
     
     
         9 . The nucleic acid of  claim 1 , wherein nucleotide sequence comprises an open reading frame encoding a protein selected from the group consisting of SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:26, SEQ ID NO:27, SEQ ID NO:28, SEQ ID NO:29, SEQ ID NO:30, SEQ ID NO:31, SEQ ID NO:32, SEQ ID NO:33, SEQ ID NO:34, SEQ ID NO:35, SEQ ID NO:36, SEQ ID NO:37, SEQ ID NO:38, SEQ ID NO:39, SEQ ID NO:40, SEQ ID NO:41, SEQ ID NO:42, SEQ ID NO:44, SEQ ID NO:45, SEQ ID NO:46, SEQ ID NO:47, SEQ ID NO:48, SEQ ID NO:50, SEQ ID NO:51, SEQ ID NO:52, SEQ ID NO:53, SEQ ID NO:54, and conservative variants thereof. 
     
     
         10 . (canceled) 
     
     
         11 . A substantially purified protein encoded by a nucleotide sequence of  claim 1 . 
     
     
         12 . A substantially purified protein comprising an amino acid sequence at least 80% identical to a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:26, SEQ ID NO:27, SEQ ID NO:28, SEQ ID NO:29, SEQ ID NO:30, SEQ ID NO:31, SEQ ID NO:32, SEQ ID NO:33, SEQ ID NO:34, SEQ ID NO:35, SEQ ID NO:36, SEQ ID NO:37, SEQ ID NO:38, SEQ ID NO:39, SEQ ID NO:40, SEQ ID NO:41, SEQ ID NO:42, SEQ ID NO:44, SEQ ID NO:45, SEQ ID NO:46, SEQ ID NO:47, SEQ ID NO:48, SEQ ID NO:50, SEQ ID NO:51, SEQ ID NO:52, SEQ ID NO:53, and SEQ ID NO:54. 
     
     
         13 . The protein of  claim 12 , comprising a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:26, SEQ ID NO:27, SEQ ID NO:28, SEQ ID NO:29, SEQ ID NO:30, SEQ ID NO:31, SEQ ID NO:32, SEQ ID NO:33, SEQ ID NO:34, SEQ ID NO:35, SEQ ID NO:36, SEQ ID NO:37, SEQ ID NO:38, SEQ ID NO:39, SEQ ID NO:40, SEQ ID NO:41, SEQ ID NO:42, SEQ ID NO:44, SEQ ID NO:45, SEQ ID NO:46, SEQ ID NO:47, SEQ ID NO:48, SEQ ID NO:50, SEQ ID NO:51, SEQ ID NO:52, SEQ ID NO:53, and SEQ ID NO:54. 
     
     
         14 . A composition comprising a protein encoded by a nucleic acid molecule of  claim 1 . 
     
     
         15 . (canceled) 
     
     
         16 . An isolated antibody that specifically binds to a protein encoded by a nucleic acid molecule of  claim 1 . 
     
     
         17 . Purified serum comprising a polyclonal antibody that specifically binds to a protein encoded by a nucleic acid molecule of  claim 1 . 
     
     
         18 - 22 . (canceled) 
     
     
         23 . A method of detecting a Bocavirus infection in a sample comprising:
 a) contacting a sample suspected of containing a Bocavirus protein with an antibody that specifically binds a polypeptide encoded by SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:13, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:43, SEQ ID NO:49, or a complement thereof to form a protein/antibody complex; and   b) detecting the presence of the protein/antibody complex, thereby detecting the presence of the Bocavirus protein.   
     
     
         24 . (canceled) 
     
     
         25 . A kit for detecting a Bocavirus in a sample, the kit comprising an antibody of  claim 16 . 
     
     
         26 . (canceled) 
     
     
         27 . A method of treating or preventing a Bocavirus infection in a subject comprising: administering to the subject an antigen encoded by a Bocavirus, the Bocavirus comprising a genome that hybridizes under highly stringent conditions to a nucleotide sequence of SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:13, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:43, SEQ ID NO:49, or a complement thereof; thereby treating or prevention infection in the subject. 
     
     
         28 - 33 . (canceled)